广东省2018年手足口病病原谱及柯萨奇病毒A10型基因特征分析
发布时间:2025-04-14 23:49
广东省手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)监测数据显示,2018年5~7月非肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)、非柯萨奇病毒A16型(Coxsackievirus A16,CV-A16)和非柯萨奇病毒A6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)的其他肠道病毒(以下简称"其他EV")阳性率大幅度增高,经鉴定60%为柯萨奇病毒A10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)。因此,为了解广东省2018年HFMD病原谱及CV-A10的基因特征,本研究收集2018年哨点监测数据进行统计分析,采集HFMD其他EV标本进行分型鉴定,并随机选取2008~2018年CV-A10阳性标本开展VP1全长序列测序与分析。结果显示,广东省2018年HFMD病原谱包括24种肠道病毒,阳性率位于前三位的分别是CV-A16(30.73%)、CV-A6(24.29%)和CV-A10(≈11.0%)。CV-A10主要流行于5~7月份,且在各市广泛流行,所致HFMD重症率低于EV-A71,却高于CV-A16和CV-A6。遗传...
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【部分图文】:
本文编号:4039736
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图5 广东省2008~2018年柯萨奇病毒A10型(CV-A10)与国内外代表株VP1系统进化树
哨点监测数据分析发现,2018年广东省HFMD优势病原为CV‐A16和CV‐A6,二者阳性率总和约占55%。其他EV的阳性率处于第3位(17.6%),但在5~7月份,其他EV与CV‐A16一起成为了引起HFMD的共同优势病原。通过对其他EV鉴定结果分析发现,共检出了包括肠道病毒A....
图6 2008~2018年广东省柯萨奇病毒A10型(CV-A10)病毒基因型分布
本研究从GenBank下载现有的CV‐A10序列,并筛选出50条国内外代表序列,与211条广东2008~2018年CV‐A10VP1全长序列开展遗传进化分析,把CV‐A10分为A、B、C、D、E、F和G等7个基因型。分子流行病学分析发现,目前A、B、D、E、F和G等基因型的流....
图2 2018年广东省手足口病(HFMD)病例其他EV分型
本研究选取广东省2008~2018年HFMDCV‐A10阳性标本,进行VP1区全长序列扩增与测序,共获得CV‐A10VP1区全长序列183条,与2015、2017~2018年在疱疹性咽峡炎监测获得的26条序列和下载自GenBank的2条深圳市代表序列一起纳入分析,一共211....
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